Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD54BQ9Y620 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms