Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE2J1Q9Y385 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2J1Q9Y385 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2J1Q9Y385 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms