Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX24Q9Y343 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX24Q9Y343 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX24Q9Y343 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms