Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SARDHQ9UL12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARDHQ9UL12 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARDHQ9UL12 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms