Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN16Q9UKR8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN16Q9UKR8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN16Q9UKR8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms