Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU2

LEF1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEF1Q9UJU2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEF1Q9UJU2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LEF1Q9UJU2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms