Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAI1Q9UI46 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAI1Q9UI46 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAI1Q9UI46 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms