Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA9Q9UGM1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA9Q9UGM1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms