Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEW3

MARCO, Macrophage receptor MARCO, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCOQ9UEW3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCOQ9UEW3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCOQ9UEW3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCOQ9UEW3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms