Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN8Q9UBY8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLN8Q9UBY8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLN8Q9UBY8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms