Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRPL39Q9NYK5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL39Q9NYK5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.1 ms