Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
VNN3Q9NY84 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VNN3Q9NY84 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms