Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 GNL3-201ENST00000394799 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 02e-6■■■■□ 25.5
AATFQ9NY61 GNL3-202ENST00000418458 2040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 25.5
AATFQ9NY61 GNL3-211ENST00000496254 2118 ntTSL 56.44□□□□□ -1.382e-6■■■■□ 25.5
AATFQ9NY61 GNL3-209ENST00000484022 668 ntTSL 24.67□□□□□ -1.662e-6■■■■□ 25.5
AATFQ9NY61 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.528e-17■■■■□ 25.2
AATFQ9NY61 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.18e-17■■■■□ 25.2
AATFQ9NY61 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)8.15□□□□□ -1.18e-17■■■■□ 25.2
AATFQ9NY61 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.218e-17■■■■□ 25.2
AATFQ9NY61 EIF4A2-204ENST00000429589 1005 ntTSL 57.51□□□□□ -1.218e-17■■■■□ 25.2
AATFQ9NY61 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 56.64□□□□□ -1.358e-17■■■■□ 25.2
AATFQ9NY61 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 54.82□□□□□ -1.648e-17■■■■□ 25.2
AATFQ9NY61 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.444e-8■■■■□ 25.2
AATFQ9NY61 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-8■■■■□ 25.2
AATFQ9NY61 EIF4A1-216ENST00000580888 710 ntTSL 220.81■□□□□ 0.921e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.921e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 518.7■□□□□ 0.581e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.571e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-228ENST00000583389 951 ntTSL 317.56■□□□□ 0.41e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-235ENST00000584860 1109 ntTSL 316.68■□□□□ 0.261e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 SNORD10-201ENST00000459579 142 ntBASIC14.51□□□□□ -0.091e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-236ENST00000584901 1021 ntTSL 214.02□□□□□ -0.171e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-218ENST00000581544 1444 ntTSL 213.47□□□□□ -0.251e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.311e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-229ENST00000583802 563 ntTSL 412.96□□□□□ -0.331e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.431e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-217ENST00000581384 642 ntTSL 512.02□□□□□ -0.491e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-209ENST00000578495 916 ntTSL 511.52□□□□□ -0.571e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-233ENST00000584784 818 ntTSL 511.51□□□□□ -0.571e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-237ENST00000585024 577 ntTSL 410.54□□□□□ -0.721e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-202ENST00000396527 1169 ntTSL 28.94□□□□□ -0.981e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-211ENST00000578754 547 ntTSL 46.63□□□□□ -1.351e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 EIF4A1-204ENST00000577731 574 ntTSL 23.87□□□□□ -1.791e-323■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 54.78□□□□□ -1.641e-73■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 RABGGTB-211ENST00000489450 586 ntTSL 52.64□□□□□ -1.991e-73■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 SLC2A4RG-207ENST00000493772 1328 ntTSL 1 (best)24.34■■□□□ 1.498e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 SLC2A4RG-202ENST00000473157 991 ntTSL 321.18■□□□□ 0.988e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.598e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.238e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 RPL23-205ENST00000470646 333 ntTSL 316.01■□□□□ 0.158e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 RPL23-207ENST00000577407 615 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.058e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 RPL23-202ENST00000378096 392 ntTSL 314.77□□□□□ -0.058e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 RPL23-203ENST00000394332 625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.058e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 RPL23-204ENST00000394333 444 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.168e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 SNORA21B-201ENST00000516890 136 ntBASIC13.21□□□□□ -0.298e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 RPL23-208ENST00000577760 3081 nt12.26□□□□□ -0.458e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 RPL23-201ENST00000245857 588 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.468e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 RPL23-206ENST00000479035 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.58e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 LARP1B-210ENST00000512292 3105 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.668e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 LARP1B-202ENST00000394288 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.688e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 RPL23-211ENST00000584912 2779 ntTSL 1 (best)10.2□□□□□ -0.788e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.078e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 LARP1B-209ENST00000508819 1891 ntTSL 58.21□□□□□ -1.098e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.168e-9■■■■□ 25.1
AATFQ9NY61 ZNF12-202ENST00000394917 662 ntTSL 330.24■■■□□ 2.438e-8■■■■□ 25
AATFQ9NY61 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.28e-8■■■■□ 25
AATFQ9NY61 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.818e-8■■■■□ 25
AATFQ9NY61 PGK1-203ENST00000476531 960 ntTSL 212.77□□□□□ -0.372e-18■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-18■■■■□ 24.9
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AATFQ9NY61 SNHG4-203ENST00000506188 801 ntTSL 417.05■□□□□ 0.321e-323■■■■□ 24.9
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AATFQ9NY61 SNHG4-202ENST00000505522 629 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.011e-323■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 MATR3-234ENST00000505016 664 ntTSL 215□□□□□ -0.011e-323■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 SNHG4-206ENST00000508735 310 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.011e-323■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.011e-323■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 MATR3-231ENST00000502394 589 ntTSL 414.52□□□□□ -0.091e-323■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.121e-323■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 SNHG4-207ENST00000513259 444 ntTSL 510.92□□□□□ -0.661e-323■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.891e-323■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.91e-323■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.381e-323■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 SNHG4-205ENST00000507692 575 ntTSL 56.11□□□□□ -1.431e-323■■■■□ 24.9
AATFQ9NY61 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 419.88■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 24.8
AATFQ9NY61 RABL6-205ENST00000435930 3328 ntTSL 216.58■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 24.8
AATFQ9NY61 RABL6-209ENST00000466096 3949 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 24.8
AATFQ9NY61 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 24.8
AATFQ9NY61 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 24.7
AATFQ9NY61 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.341e-6■■■■□ 24.7
AATFQ9NY61 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.161e-6■■■■□ 24.7
AATFQ9NY61 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 24.7
AATFQ9NY61 WDR43-201ENST00000296126 787 ntTSL 53.6□□□□□ -1.832e-21■■■■□ 24.4
AATFQ9NY61 WDR43-204ENST00000440983 541 ntTSL 42.93□□□□□ -1.942e-21■■■■□ 24.4
AATFQ9NY61 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.362e-21■■■■□ 24.4
AATFQ9NY61 FAM182B-203ENST00000424021 605 ntTSL 517.32■□□□□ 0.366e-7■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 PFKP-207ENST00000421751 658 ntTSL 419.18■□□□□ 0.663e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 PFKP-204ENST00000407806 705 ntTSL 516.97■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 PFKP-212ENST00000607886 432 ntTSL 516.47■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 TMEM248-205ENST00000433271 1610 ntTSL 1 (best)31.69■■■□□ 2.661e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.221e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 TMEM248-207ENST00000607045 690 ntTSL 326.83■■□□□ 1.891e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 24.3
AATFQ9NY61 SLC6A6-205ENST00000613930 988 ntTSL 223.63■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 24.3
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