Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A9Q9NUM3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A9Q9NUM3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms