Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTPS2Q9NRF8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms