Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DUOX1Q9NRD9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DUOX1Q9NRD9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms