Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARVBQ9HBI1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms