Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UPF2Q9HAU5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF2Q9HAU5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms