Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COG4Q9H9E3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG4Q9H9E3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms