Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1DQ9H5J8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TAF1DQ9H5J8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms