Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC113Q9H0I3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC113Q9H0I3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC113Q9H0I3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms