Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIF3L1Q9GZT8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIF3L1Q9GZT8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIF3L1Q9GZT8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIF3L1Q9GZT8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIF3L1Q9GZT8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NIF3L1Q9GZT8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NIF3L1Q9GZT8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NIF3L1Q9GZT8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NIF3L1Q9GZT8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIF3L1Q9GZT8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms