Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GPR88Q9GZN0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms