Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A8Q9C0K1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC39A8Q9C0K1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms