Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC27Q9C0I9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRC27Q9C0I9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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