Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRRTQ9BXP5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRRTQ9BXP5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms