Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDF4Q9BRK5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms