Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM1Q9BR11 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM1Q9BR11 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms