Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TREX2Q9BQ50 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TREX2Q9BQ50 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.8 ms