Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT12Q99456 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT12Q99456 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT12Q99456 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms