Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMS19Q96T76 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms