Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF13CQ96RJ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF13CQ96RJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms