Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED3Q96IU2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZBED3Q96IU2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED3Q96IU2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms