Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGSM3Q96HU1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGSM3Q96HU1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM3Q96HU1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms