Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO1Q92973 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO1Q92973 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO1Q92973 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO1Q92973 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO1Q92973 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNPO1Q92973 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO1Q92973 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNPO1Q92973 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO1Q92973 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO1Q92973 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO1Q92973 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO1Q92973 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO1Q92973 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO1Q92973 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO1Q92973 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO1Q92973 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO1Q92973 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO1Q92973 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNPO1Q92973 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO1Q92973 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO1Q92973 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO1Q92973 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO1Q92973 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO1Q92973 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO1Q92973 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO1Q92973 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO1Q92973 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNPO1Q92973 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNPO1Q92973 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNPO1Q92973 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNPO1Q92973 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO1Q92973 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO1Q92973 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO1Q92973 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO1Q92973 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO1Q92973 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO1Q92973 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO1Q92973 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNPO1Q92973 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TNPO1Q92973 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNPO1Q92973 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNPO1Q92973 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms