Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMPDL3AQ92484 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 624.9 ms