Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBA3Q8TBC4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA3Q8TBC4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms