Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP11CQ8NB49 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms