Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIM42Q8IWZ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM42Q8IWZ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms