Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWY4

SCUBE1, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE1Q8IWY4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE1Q8IWY4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms