Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIBP1Q86W92 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms