Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUSD1Q6UWL2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD1Q6UWL2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD1Q6UWL2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms