Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF7Q6Q0C0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms