Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI26

SHQ1, Protein SHQ1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1Q6PI26 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SHQ1Q6PI26 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHQ1Q6PI26 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHQ1Q6PI26 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHQ1Q6PI26 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHQ1Q6PI26 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHQ1Q6PI26 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHQ1Q6PI26 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHQ1Q6PI26 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHQ1Q6PI26 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHQ1Q6PI26 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms