Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A2

GALNT18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18Q6P9A2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALNT18Q6P9A2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GALNT18Q6P9A2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT18Q6P9A2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms