Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCTP1Q6DN14 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCTP1Q6DN14 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms