Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPECC1LQ69YQ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPECC1LQ69YQ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms