Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALS2CLQ60I27 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALS2CLQ60I27 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms