Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4orf46Q504U0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf46Q504U0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C4orf46Q504U0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C4orf46Q504U0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf46Q504U0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf46Q504U0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf46Q504U0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf46Q504U0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf46Q504U0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf46Q504U0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms