Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01559Q495D7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01559Q495D7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01559Q495D7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01559Q495D7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01559Q495D7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01559Q495D7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01559Q495D7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01559Q495D7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01559Q495D7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01559Q495D7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms